Ο τομέας επιδημιολογίας του ΕΚΤΕΠΝ εφαρμόζει πέντε (5) βασικούς επιδημιολογικούς δείκτες προκειμένου να αποτυπώσει με έναν ποσοτικό, μεθοδολογικά έγκυρο και αντικειμενικό τρόπο την κατάσταση του προβλήματος των ναρκωτικών στην Ελλάδα. Οι δείκτες αυτοί έχουν αναπτυχθεί με τη συνεργασία του EUDA και με τα υπόλοιπα Εθνικά Κέντρα των χωρών του πανευρωπαϊκού δικτύου REITOX, καθώς και με τη συμμετοχή ειδικών εμπειρογνωμόνων και οργανισμών οι οποίοι ειδικεύονται σε θέματα χρήσης και εξάρτησης από ψυχοδραστικές ουσίες.